El presente artículo corresponde a una sección de la investigación perteneciente a la tesis de maestría “Utilización de materiales audiovisuales para la promoción del pensamiento crítico y la argumentación”. En este marco, se analiza el rol de los recursos audiovisuales en la enseñanza de la Biología en la escuela secundaria, contrastando las prácticas y valoraciones del profesorado con las percepciones y preferencias del estudiantado fuera del aula. Se implementó un enfoque mixto con diseño descriptivo-exploratorio. Donde se realizaron entrevistas semiestructuradas a docentes de Ciencias Naturales y se aplicó un cuestionario estructurado a 55 estudiantes de cuarto y quinto año de una institución educativa de nivel secundario en Posadas, Misiones. Los resultados revelan que los docentes utilizan videos cortos de YouTube y animaciones, mientras que limitan el uso de largometrajes debido a la rigidez del tiempo escolar. Por su parte, el estudiantado muestra una marcada diferenciación entre sus preferencias de ocio y sus expectativas escolares. Aunque en su tiempo libre dedican un promedio mayor a cinco horas diarias a películas y series de ficción y comedia, dentro del aula validan y demandan mayoritariamente el uso de documentales y películas biográficas. Se concluye que los jóvenes realizan una apropiación crítica y situada de los materiales audiovisuales, reconociendo a la escuela como un espacio legítimo de transmisión de conocimiento disciplinar valioso. Asimismo, sus valoraciones respaldan las decisiones pedagógicas y la experiencia áulica del profesorado, quienes seleccionan y adaptan los recursos en función de su pertinencia científica y su eficacia para la comprensión.